茶樹高密度遺傳圖譜構建取得重要進展
遺傳圖譜既是茶樹遺傳研究的重要手段，又是加速茶樹分子標記育種的有力工具。長期以來，由于作圖群體類型和分子標記數量的限制，已構建的茶樹遺傳圖譜在標記密度、基因組覆蓋度等方面都有待提高。近日，我所茶樹種質資源創新團隊構建了首張茶樹高密度遺傳圖譜。該團隊采用簡化基因組測序技術對一個F1全同胞家系進行高通量測序，獲得了101091個高質量的序列標簽，隨后通過基因型編碼開發出18846個SNP標記，剔除親本信息缺失、完整度過低和不適合該群體作圖的多態性標記后，獲得6042個可用于構建圖譜的SNP標記，并聯合406個SSR標記構建了包含15個連鎖群、3973個位點(包含1470個bin和2543個單標記)、總圖距3965 cM、標記間平均距離為1.0cM的高密度遺傳圖譜。同時，通過等位基因和合子偏分離檢驗還發現，該作圖群體中81.5%偏分離標記是由配子選擇引起的，4.9%由合子選擇導致的，10.0%由配子和合子共同選擇導致的。研究結果在最近一期《PLoS One》(《公共科學圖書館-綜合》)(doi:10.1371/journal.pone.0128798)上發表。
該研究構建的高密度遺傳圖譜為進一步開展茶樹QTL精細定位、基因圖位克隆和分子標記輔助育種等研究提供了平臺。該研究得到了國家自然科學基金、現代農業產業技術體系、中國農業科學院科技創新工程、浙江省農業新品種選育重大科技專項等項目的支持。
圖1 遺傳圖譜信息統計
圖2 連鎖群標記位點分布情況
圖3 偏分離標記類型和分布模式
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